根据相关法规，营运车辆三年不进行年审属于违法行为，需要依法处理。首先，车主应立即联系当地交通管理部门，申请补办年审手续，并缴纳相应的滞纳费用。同时，交通管理部门可能会对车辆进行检查，确保车辆符合安全标准后方可重新获得年审合格证。此外，车主还可能面临罚款和其他法律责任。因此，建议车主务必及时办理年审手续，遵守交通管理规定，确保车辆合法合规运营。