学生收取保护费是一种违法行为，校园欺凌的严重表现，按照学校纪律和法律法规来处理。学校通常会对学生进行严厉的处罚，包括但不限于警告、停学、记录信誉等级、社区服务或法律起诉。对于严重的情况，可能会涉及刑事责任，需要受到法律的惩罚。同时，学校还应积极开展相关教育宣传工作，加强对学生的心理辅导和社会责任教育，促进校园和谐稳定的发展。