根据目前的政策，北京硕士研究生三年户口的流程如下：首先，申请人需要在入学时向学校提出户口迁移申请，并提供相关材料。学校会协助申请人办理迁户口手续，包括填写迁户口申请表、提供身份证、学籍证明等。然后，学校将申请人的材料提交给当地派出所进行审核。审核通过后，派出所会发放迁户口证明。最后，申请人携带迁户口证明和其他相关材料前往当地户籍所在地的派出所办理户口迁移手续。整个流程需要一定的时间，具体办理时间会根据当地政策和工作效率而有所不同。