自发麦芯粉和自发面粉在原料、制作方法和用途上有明显的区别。

1. 原料：自发麦芯粉是由小麦中心部分的胚乳磨制而成的小麦面粉，而自发面粉是以小麦粉为原料，经过添加膨松剂预混而成的面粉。

2. 制作方法：自发麦芯粉是通过精细加工制成，其面筋质量和加工精度都比普通面粉高。而自发面粉是在小麦粉中添加一定量的膨松剂制成，方便快捷。

3. 用途：自发麦芯粉适合制作各种高档面点，如酒店、宾馆等高级面点制作，也适用于家庭面食如面条、水饺、馄饨等面食。自发面粉则更适合制作发酵类食品，如馒头、蛋糕和油条等。

总的来说，自发麦芯粉和自发面粉在原料、制作方法和用途上都有所不同，可以根据自己的需求选择合适的产品。