新公司需要在海关进行备案，流程主要包括：

1.办理海关注册登记；

2.办理企业进出口权；

3.申请海关备案；

4.提供产品信息和企业资料；

5.缴纳备案费用；

6.等待海关审核。审核通过后，企业才能正式进行海关进出口的业务活动。备案流程需要注意提供真实准确的资料，遵守相关规定，确保备案顺利通过。