在有龙眼树的土地上申请建房会受到一定的限制。首先，龙眼树可能被认为是一种特殊的植物，保护起来可能需要遵循相关法规和政策。

其次，如果龙眼树是在农村或自然保护区，建房行为可能在环保、土地使用和规划管理上受到严格监管。因此，在有龙眼树的土地上申请建房需要经过相关部门的审批，并且需要考虑保护龙眼树的合法性和生态环境的可持续性。最终，具体情况需要具体分析，需要进行详细的调查和咨询相关部门的意见。