水井净水的方法有多种，可以通过安装滤水器、反渗透膜等设备进行净化处理，也可以使用砂滤器、陶瓷过滤器等物理过滤方法。同时，还需要做好水井周围环境卫生管理，防止污染源的侵入。需要注意的是，水井的水质和净化方法需要根据不同地区的水质情况而定。

总之，保持水井周围环境卫生、使用适当的净化设备和方法，以及定期检测水质是保证水井水质安全的重要措施。