阴性杆菌一般指的是革兰氏阴性杆菌。

革兰氏菌，通过革兰氏染色法，能够把细菌分为两大类。

采用这种染色方法，是先用龙胆紫（亦称结晶紫）来染病菌，所有细菌都染成了紫色，然后再涂以革兰氏碘液，来加强染料与菌体的结合，再用95%的酒精来脱色20～30秒钟，有些细菌不被脱色，仍保留紫色，有些细菌被脱色变成无色，最后再用复红或沙黄复染1分钟，结果已被脱色的细菌被染成红色，未脱色的细菌仍然保持紫色，不再着色，这样，凡被染成紫色的细菌称为革兰氏阳性菌(G﹢菌)；染成红色的称为革兰氏阴性菌（Gˉ菌）。