根据中国海关的规定，所有入境和出境的船舶都需要向海关申报。如果您是指乘坐船只从黄浦江出发前往上海市区，那么通常情况下，船公司会负责办理相关的手续和申报。如果您是指自己驾驶船只从黄浦江出发前往上海市区，那么您需要在抵达上海之前向当地的海事管理部门申报，并提供相关证件和信息。

总之，无论您是乘坐商业船只还是私人船只，都应该遵守相关的规定和程序，确保自己的行程顺利和安全。建议您在出发前向当地的海事管理部门咨询相关规定和要求。