如果车主不在，想要补办登记证书，可以委托他人代办。具体操作方法是，车主准备好相关委托书和身份证明材料，然后委托受托人携带以上材料和车辆行驶证、身份证到当地车管所进行申办。在补办登记证书时，需要缴纳相关费用，并且需要承担一定的时间成本。所以建议车主提前规划好行程，避免过滤出现补办登记证书的情况。