是合法的。

合同主体由总公司变更成分公司之后法律责任还是要由总公司来承担的，因为从始至终分公司没有独立的法人资格的，不过，就算是劳动合同要从总公司变更成为分公司，包括其他的民商合同，签合同的主体发生变更后是要跟合同相对人协商决定的。