根霉曲和酵母曲是两种不同的发酵制品，它们在发酵方式、工艺流程以及最终产品的味道上都有所区别。

发酵方式：

根霉曲在发酵时需要借助肥料或其他辅料进行培育，其发酵过程相对复杂1。

酵母曲在发酵时则需要添加水，可以直接投入面粉中发酵1。

工艺流程：

根霉曲的培育过程比较复杂，需要更多的技术和经验1。

酵母曲的工艺流程相对简单，易于操作1。

产品味道：

使用根霉曲制成的酱油、醋等，其味道通常显得更为鲜甜1。

使用酵母曲发酵后，产品气味较为芳香，口感较为鲜美1。

综上所述，根霉曲和酵母曲在发酵工艺和使用效果上存在显著差异。