农村自建房两间2层楼梯可以根据具体的空间布局和需求来设计。一般来说，可以考虑以下几种方式：

1. 将两间房各自设置一个楼梯口，分别连接到楼上的相应房间。这样可以使得每间房都有独立的楼梯通道，方便使用。

2. 如果两间房的位置比较靠近，也可以考虑设计一个共用的楼梯口，让两个楼梯同时连接到同一个楼上空间。这种方式可以节省空间，但可能会造成楼梯使用的交叉和干扰。

3. 在设计楼梯的时候要考虑到安全和舒适性，确保楼梯的坡度和踏步长度符合人体工程学要求，同时要保证楼梯的承重能力和稳固性。

需要请专业人员具体规划和设计，确保楼梯设置符合相关建筑规范和安全标准。