不可以必须分开邮寄，护照和港澳通行证是不同证件类型，故按照规定的确会被分开邮寄。按照相关规定，在出入境部门办理了多个出入境证件并选择EMS快递服务的，需要符合同一证件类型、同一收件地址、同一联系人、同一联系电话且在同一时间同一窗口办理等多个条件，进行了分拣，EMS方面才会对分拣好的多个证件进行一次性捆绑邮寄。