要保存透明的 AI 格式的 Logo，可以按照以下步骤进行操作：

打开 AI 文件，确保 Logo 的背景是透明的。

点击“文件”菜单，选择“另存为”。

在“另存为”对话框中，选择“Adobe Illustrator（ai）”作为保存格式。

点击“选项”按钮打开“Adobe Illustrator（ai）选项”对话框。

在“Adobe Illustrator（ai）选项”对话框中，勾选“创建 PDF 兼容文件”和“使用透明度”。

点击“确定”按钮返回“另存为”对话框。

在“另存为”对话框中，选择保存的文件路径和文件名，然后点击“保存”按钮。

这样，您就可以将透明的 AI 格式的 Logo 保存到您的电脑上了。需要注意的是，保存透明 Logo 时，应该确保 Logo 的背景是透明的，并在保存选项中勾选“使用透明度”，以保证保存的 Logo 能够保持透明效果。