分馏椰子油与普通椰子油的主要区别体现在其加工过程、物理状态、储存稳定性以及使用方式等方面。
首先，分馏椰子油大多是以初榨椰子油为原料精制而成，其过程涉及分馏，也就是通过加热使椰子油在不同温度下蒸发和冷凝，从而分离出不同沸点的组分。而普通椰子油则是直接从椰子肉中提取的，加工过程相对简单。
其次，在物理状态上，分馏椰子油经过精炼和分馏后，其凝固点降低，即使在低于24℃的环境下也不会凝固，始终保持液态，这使得它在冷藏条件下也能方便使用。而普通椰子油在室温下通常是固态，呈乳白色。
再者，分馏椰子油的最大优势在于其储存稳定性高。由于经过精炼和分馏，它不易变质，耐高温，且不需要特别的储存和处理过程，放在阴凉干燥处即可。而普通椰子油则比较容易酸败，因为其中含有相当数量的低级脂肪酸。
最后，在使用方式上，分馏椰子油常被用作精油和按摩油的载体油，它能与其他精油完全融合，帮助精油很好地渗透进皮肤，滋润肌肤，降低敏感度。而普通椰子油虽然也有其用途，但在这方面则不如分馏椰子油来得方便和有效。