第一代和第二代。近亲结婚对后代的影响只在于后代患某些遗传病(由隐形基因控制的)的几率高于普通人,即控制同一遗传病的隐性基因结合,使其控制的遗传病得以表现的几率高。

所以不会影响到第三代,即使第三代有什么问题也与第一代近亲结婚无关。