蓝色和绿色的区别主要在于护套材质和用途。蓝色光纤跳线的护套材料通常为低烟无卤材料，这种材料在燃烧时不会产生有毒烟雾，并且具有较好的阻燃性能，适用于室外和室内布线环境。而绿色光纤跳线的护套材料通常为阻燃聚氯乙烯（PVC）材料，这种材料在燃烧时会产生有毒气体，因此不适用于室外环境，但价格相对较低，适用于室内布线环境。
此外，蓝色光纤跳线通常具有较高的传输性能和机械性能，适用于长距离、高速数据传输等高要求的应用场景。而绿色光纤跳线则通常用于短距离、低速数据传输等较低要求的应用场景。
总的来说，蓝色和绿色光纤跳线在护套材质、用途、传输性能和机械性能等方面存在一定差异，需要根据具体的应用场景选择适合的光纤跳线类型。