小珠山隧道共有三个出口。

这是因为小珠山隧道是连接两个山区的交通工具，为了方便过往车辆的出入，设有三个出口，便于车辆选择离自己最近的出口，从而节省时间和费用。

同时，这也是确保道路通行和交通安全的重要措施。