法律形式不同：蔬菜配送注册公司具有法人资格，而个体工商户则不具有法人资格。
承担责任不同：蔬菜配送注册公司以其注册资本为限承担有限责任，而个体工商户则需要承担无限连带责任。
规模不同：蔬菜配送注册公司后期可以成立分公司等分支机构，规模较大，而个体工商户规模较小，不能成立分支机构。
申报税务不同：蔬菜配送注册公司需要申报个人所得税、企业所得税、增值税等，而个体工商户只需申报生产经营所得税。
综上，蔬菜配送注册公司和个体工商户在法律形式、承担责任、规模和申报税务等方面存在明显的区别。选择合适的注册方式需根据实际需求和条件综合考虑。