高层小区地下变电站距离是有影响的。变电站会产生电磁场，在距变电站较近的地方，电磁辐射较强，可能会对人体健康产生影响。此外，距离过近的地下变电站也会对小区的环境和安全带来一定隐患。因此，建议在小区规划中充分考虑地下变电站的距离，避开生活区和公共活动区域，保持足够的距离，确保小区居民生活的安全和健康。