根据流传的故事，骷髅岛的毁灭与1948年一支战后探险队的到来有关。当时岛上爆发了规模9.2级的大地震，这场地震不仅导致了史前生物的灭绝，也由于地质上的不稳定性，使得骷髅岛最终被海洋吞没。

这一事件标志着骷髅岛的毁灭，也使得这个曾经充满神秘与传奇色彩的小岛永远消失在历史的长河中。