根据我所了解的情况，重庆公积金可以逐年抵扣办理商业贷款本金。根据重庆市住房公积金管理中心的规定，职工可以通过公积金账户余额逐年抵扣商业贷款本金。具体操作方式是通过市住房公积金微信公众号、个人网厅等线上服务平台，自助办理公积金贷款按月冲还贷签约。

在还款期内，职工可以按月使用公积金账户余额，在商业贷款还款日直接冲抵商业贷款本金，不足部分仍从职工贷款还款卡中扣取。