玉缀多肉的根系是否需要修剪，取决于其根系的发达程度。如果根系比较发达，建议把侧根剪掉，只留主根，否则会影响新根的发育，导致生长速度变慢。剪的时候注意不要伤到叶片。如果根系不是很多，则不用修剪，直接清洗晾干后栽种即可。
此外，根系的修剪除了与多肉的状态有关，还与品种有关。一些品种的多肉可能需要修剪根系，例如玉露类、寿类、生石花、石莲花属（吉娃莲、东云系列、花月夜等），尤其是根系发达的品种。而一些品种的多肉则不太需要修剪根系，例如姬秋丽、珍珠吊兰、新玉缀、紫弦月、莲花掌属（玉龙观音、黑法师等）、景天属（姬星美人、薄雪万年草等）。
在修剪完根系后，需要将多肉放在阴凉通风处2天，等根系伤口风干后，准备潮土栽种到花盆里，然后放阴凉通风处等其缓盆。