药店的转让价值估价包括以下三个方面：

一、估价依据：以国家有关法规为依据，如《中华人民共和国药品经营许可证》等；

二、估价基础：药店的实物财产，包括药局设备、建筑物、场地、库存销售药品等；

三、估价指标：国家有关医药行业经营数据、当地医药市场销售情况以及行业市场表现信息等。

药店转让时还要考虑包括当地诊所数量及用户群、经营状况以及客户群的变化、公司成长能力及价值承认等因素，以判断药店的实际价值。