旗山万佛寺离最近的地铁站是旗山站，从旗山站可步行约15分钟即可到达寺庙。另外，也可以在旗山站搭乘当地的公交车，大约5分钟的车程即可抵达万佛寺。同时，从旗山站也可以搭乘的士前往寺庙，车程大约5分钟左右。总体来说，旗山站是离万佛寺最近的地铁站，乘坐公交或的士都是便捷的方式前往寺庙。