沤制鱼肠彻底腐熟后，其外观和气味都会发生显著变化。首先，原本较为完整的鱼肠会逐渐变得模糊，难以辨认其原始形态，因为有机物在分解过程中会逐渐消解。

其次，颜色可能从初始的鲜艳转为较为暗淡的色调，这是微生物分解有机物的自然过程。

同时，气味也会发生明显变化，由一开始的鱼腥味转变为较为温和的土壤气息，这表明鱼肠已经充分腐熟，其中的有害物质已被大量分解。这样的鱼肠肥料就可以安全地用于植物的生长了。