动车晚点的原因有多种，主要包括以下几个方面：

1.天气原因和地质灾害：在恶劣的天气条件下，如大雪、暴雨等，为了确保行车安全，高铁会限速行驶甚至停运。此外，地质灾害如地震、滑坡、泥石流也可能导致线路中断或限行限速。这些因素都可能导致列车晚点。

2.设备故障：供电设备、列车、轨道或者信号等设备出现故障时，高铁需要暂时停止运行以进行维修或更换设备。例如，电力故障会导致双线路供电失效；机车故障和操作失误可能损伤线路岔间等。这些情况下，必须等待故障排除后才能继续运行。

3.人为因素：人为原因导致的晚点包括乘客行为（如在车上吸烟触发紧急制动）以及区间调度困难等问题。客流密集时段旅客进站上车难度加大，上下车时间增加，可能导致列车发车延误。节假日期间由于客流量大，列车运行图调整不当也容易导致晚点。

4.待避让其他列车：等级低的列车在运行过程中可能需要中途避让等级高的列车，特别是动车组开行后，原先的一些特快列车也会因为待避而减速慢行。这种情况下，多趟列车的停留时间会累加，从而导致更长时间的晚点。

5.运行事故：虽然较少见，但列车在运行时发生撞人事件或其他事故事件需要一定时间处理现场并调查原因。这类情况通常会造成较严重的晚点现象。