两轮电动车控制器故障的检测方法主要有以下几种：
万用表检测法：
将万用表置于二极管档进行测量。
使用万用表的红标接触电动车控制器的粗黑线。
将万用表的黑笔分别放在粗蓝、黄、绿线上进行测量。
如果阻值显示的是0欧姆，那就说明电动车控制器是坏的。
电机转动测试法：
插上电源并插好相位线后，尝试用手转动电机。
如果感到有明显的阻碍力，那就可能是控制器的功率管出现了问题，这时需要考虑更换控制器。
电机声音检测法：
启动电动车后，仔细听电机的声音。
如果电机在发出异常的声音，或者一开始可以启动但达到一定速度后突然停止，则表明电动车控制器可能存在故障。
电路信号检查法：
通过检查控制器外围的控制信号来判断是否正常，比如转把的控制信号和刹车信号等。
如果转把信号始终为0伏，那可能是转把信号问题，而非控制器问题。
如果刹车信号异常，可以尝试临时脱掉刹车线来验证。
对比实验法：
使用一个新的控制器和现在使用的控制器做对比实验。
温度较低的那个通常可以认为是工作正常的控制器。
整车脱离法：
关掉电源，将控制器与整车脱离。
拔掉接入控制器的电源线以及与电机相连的线。
将电源线直接与电机线相连，然后打开电源开关。
如果电机正常运转，那就说明是控制器损坏了。
在检测过程中，请注意安全，并确保电源已经关闭。如果对电动车的控制器结构和工作原理不熟悉，建议寻求专业维修人员的帮助，以避免因操作不当造成进一步的损坏或安全隐患。